达州市生态环境局为市政府工作部门。机关内设机构设置为:
办公室、法制与宣传科、大气环境科、水环境管理与生态保护科、土壤环境管理与生态监测科、核与辐射监督管理科、综合业务与环境应急信访科、行政审批科(环境影响评价与排放管理科、科技与财务科、党建办(人事科)、机关党委。
市生态环境局机关行政编制31名。其中,局长1名、副局长3名,机关党委书记1名,总工程师1名,环保总监1名;正科级领导职数11名(含机关党委专职副书记1名),副科级领导职数7名。
保留机关工勤人员控制数2名。